从火山公园出来右侧有一片海域，用拉普拉斯进入，可以找到基格尔德细胞，招式机器73“电磁波”，黄金喷雾。钓鱼阴影处冒泡有可能钓到珍奇宝可梦。
从8号道路前往树荫丛林，进行玛奥队长的考验。第一个屋子里可以做帮以太基金会找童偶熊的任务。路上遇到阿克罗玛，赠送主角招式机器43“蓄能焰袭”，学会将对击败树荫丛林的霸主有帮助。
注意在路上收集基格尔德细胞，奇迹种子。路中间右侧的化石复原所能找到雷之石，道路尽头的旅店客房全满，遇到格拉吉欧，居然让主角出去(哼~出去就出去)。PC中心下方的海边有胆小虫出没，需要有坐骑才能快速追上。进入这片水域能找到水之石，战胜跆拳道训练家。这时可以返回8号公路入口与美女对战了，胜利后能得到招式机器58“自由落体”。
从5号道路进入树荫丛林，进到玛奥队长，让主角去收集4样东西(芒芒果，小蘑菇，复活草，奇迹种子)，并给了材料袋。根据每个区域的指示牌提示认真搜索，很快能够收集全。奇迹种子需要肯泰罗击碎石头发现。丛林深处的树洞里能找到招式机器86“打草结”。
收集齐以后找玛奥，卡奇带来粗骨头贵重骨头，水莲带来美味之水和凸凸头盔，玛奥开始做霸王宝可梦料理，召唤出来打主角?她怎么想的==b。于是主角用骨头帮着捣啊捣，捣啊捣~我勒个去!霸王宝可梦懒螳花出现!!!(LV24)击败后得到草Z和10个巢穴球。众人分吃了剩下的料理，口舌发麻四散找水去了…库库伊博士出现，给了主角招式机器67“修长之角”。
向下进入5号公路，路左侧有基格尔德细胞，招式机器59“狂舞挥打”。打败训练家后，还记得5号公路入口的大叔么?击败大叔(LV22呆呆兽)可获得招式机器96“自然之力”。
在牧场遇到哈乌，这小子居然说玛奥的特别料理好吃，嘴不麻?从6号道路一直向下就是空间研究所，路上有神奇糖果。空间研究所门口遇到莉莉艾，寒暄几句进入，见到库库伊博士和他太太芭内特(兼研究所所长)。芭内特告诉众人，阿罗拉之谜就是究极之洞，传说有恐怖宝可梦-究极异兽从天空的洞里出来。从研究所出来主角看到天空的裂痕…
进入地鼠隧道，发现丽姿和以太集团的人在交代着什么，途中又看到以太集团的人。打败隧道里所有的训练家能和入口的空手道Z训练家对战(LV23铁掌力士)，获胜得到活力块。洞口遇见骷髅队(LV22伪螳草，LV22夜盗火蜥)，和哈乌一起打败他们，得到PP单项全补剂。洞里能找到火之石，金珠，基格尔德细胞。
出隧道沿9号道路前进，海边能找到命中强化。到达可霓可市，具有中国特色的建筑音乐哈。路边小铺有幸运熏香(战斗双倍金钱)，PC中心能接捕捉投掷猴的任务。
在丽姿的时装店铺看到丽姿留的信，让主角去生命遗迹找她，还得知丽姿没有男友…上二楼丽姿的房间找到基格尔德核心，吉娜来电让主角关注16号道路上的以太基地。主角又上了丽姿的床…你们都猜到了啊…
海边的美女会给主角皮卡丘Z，并教给皮卡丘十万伏特，旁边找到进化奇石。
在回忆之丘碰到以太队和骷髅队(LV23拉达)，击败后救下呆呆兽，以太美女承诺带主角从豪诺豪诺度假地前往非常棒的地方。向前能找到基格尔德细胞，招式机器28“吸血”。骷髅队大姐大布尔美丽(LV25大嘴蝠，LV26夜盗火蜥)出现。调查遗迹的墓碑，能发现洁净之符，诅咒之符等。
到达生命遗迹，芭内特和莉莉艾出现，芭大嫂坏笑着说去看蒙面人比赛就把孤男寡女的留在了野外…莉莉艾帮主角恢复了体力。丽姿队长出现(LV26朝北鼻，LV27鬃岩狼人，LV26地幔岩)，击败后得到岩石Z，完成大考验。
前往豪诺豪诺度假地，进入酒店遇到扎奥博，告知主角伟大地方是以太乐园，一个漂浮在阿罗拉海面上的宝可梦乐园，也是一座人工岛。众人赶来相送，丽姿刚说单身，库库伊博士就借口留下…哈乌与主角乘船前往以太乐园。提示：酒店左侧展示宝可梦成长获得脚印奖章，左上可与高尔夫组合训练家对战(LV25花舞鸟)，获胜得到招式机器45“迷人”。与训练家(LV27喇叭啄鸟)对战，获胜得到节拍器。
豪诺豪诺海滩可找到基格尔德细胞，可用长毛狗搜索清理海滩。还可以做清理海滩的任务，将6只券海参扔回海里，就能得到20000元，超爽!而且，每天都能来做这个任务。
到达以太乐园，在碧珂的带领下参观人工岛，介绍以太基金会在努力保护宝可梦达到自然平衡。见到逆生长理事长露莎米奈(40岁)。突然地面颤动，天空中出现虚吾伊德(LV27)，主角击败后消失了。露莎米奈认为虚吾伊德肯定是究极异兽，是未知次元里的生物，刚才意外出现在这里很痛苦，要救救他。碧珂送主角离开，并给了招式机器29“精神强念”。以太乐园一层上方可找到神奇糖果。
乘船到达乌拉乌拉岛的马利埃静市，先与乌拉战斗(LV28雷丘，LV28水伊布，LV29投羽枭)，然后前往马利埃庭园，与乌拉一起寻找茶座。
