《初音未来：歌姬计划MEGA39's》包含了这十年来初音未来系列的经典歌曲共计100支，加上为本作全新制作的新主题歌一共101曲，新增加的歌曲已经确定的有：エイリアンエイリアン 和 39みゅーじっく！。使用全新3D模型的初音看起来更加可爱、帅气，游戏中可供选用的服装达到了300种以上。《初音未来：歌姬计划MEGA39's》还与日本网站piapro进行合作，由粉丝们设计出的T恤会被选用到游戏中。