洛克人 X 反乱猎人故事叙述21世纪一手创造出元祖洛克人的托马斯．莱特（ThomasRight）开发出了全新的机器人“艾克斯（X）”，但因为其无穷的潜力所带来的不确定性，因此莱特博士将之封印。经过数十年之后，22世纪的科学家该隐（Gain）博士发现了封印中的艾克斯，并根据艾克斯的技术开发出具备自我思考能力的机器人，相关应用迅速的普及，使得人类社会的发展获得很大的帮助。